При большом количестве атрибутов, на некоторых хостерах могут быть ограничения, из-за чего не будет работать привязка некоторых (обычно те, что снизу) атрибутов к товару. Можно попробовать в .htaccess в корне магазина добавить: php_value max_input_vars 5000 Либо изменить значение опции max_input_vars в php.ini
