В Админке - Оформление - Шаблоны - Основной шаблон после:
<link rel="shortcut icon" href="{base_path}/favicon.ico"/>
добавляйте:
<link rel="canonical" href="{$smarty.const.FULL_BASE_URL}{$smarty.const.BASE}/{$content_type}/{$content_alias}{config value=URL_EXTENSION}" />
