Здравствуйте!
Бонус да, настраиваются в Админке - Настройки - Основные - Мой магазин - Сколько процентов начислять бонусами
При регистрации вроде не даёт бонусов, это просто по умолчанию для админа добавлено 300 бонусов
Их можно убрать или добавить в Админке - Покупатели - Клиенты справа кнопка Баланс